What did she do ou what did she does?

Olá, amigos, sou novo aqui! Tenho esta dúvida. Vi em alguns fóruns que a forma correta é "What did she do". Mas nós aprendemos que após He/She/It devemos utilizar o "Does", então gostaria de saber por que devemos usar desse jeito, existe algum tipo de regra? É algo relacionado à tempos verbais? Caso haja regra, vale para Has e Have também? Enfim, obrigado a quem responder!
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What did she do? = O que ela fez? (passado)
What does she do? = O que ela faz (presente)

She did = Ela fez (passado)
She does = Ela faz (presente)